合作协议中的竞业限制具有法律约束力。依据《劳动合同法》等，合法合规且双方主体适格的竞业协议有效。未及时处理违约，可能导致商业秘密泄露，造成重大损失。
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竞业限制具约束力。处理方式：1.协商，双方按协议条款友好沟通；2.诉讼，协议有争议或遭违约时，收集证据，向法院提起诉讼；3.若违约，还可要求赔偿，依据协议及《劳动合同法》追索经济补偿。
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处理竞业限制问题，常见方式有协商、诉讼等。若协议条款明确且双方无异议，可协商解决；若存在争议或违约，应通过法律途径诉讼解决，以确保权益。