学校限制人身自由是违法的。分析说明：根据法律规定，公民享有人身自由权，非经法定程序，任何组织或个人都不得限制或剥夺。学校作为教育机构，其职责是教育和培养学生，而非限制学生的人身自由。若学校采取不当措施限制学生自由，如非法拘禁、强制隔离等，均构成对学生人身自由权的侵犯，应承担相应的法律责任。提醒：若学生被学校非法限制自由，且持续时间较长、手段恶劣，或造成严重后果，如身心健康受损，应及时寻求法律援助，维护自身权益。
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具体操作：1. 协商沟通时，应明确表达自身被限制自由的事实和诉求，要求学校立即停止侵权行为，并提供合理补偿。2. 投诉举报时，应准备好相关证据材料，如录音、录像、书面材料等，证明学校存在限制人身自由的行为。同时，按照行政机关的要求填写投诉举报表，详细陈述问题。3. 法律诉讼时，应咨询专业律师，了解诉讼程序和自身权益。在律师的指导下，准备充分的证据材料，如证人证言、书证等，以支持自己的主张。同时，按照法院的要求参与庭审，积极维护自身权益。在诉讼过程中，还可考虑申请法律援助或调解等，以寻求更为合理的解决方案。
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处理方式：从法律角度，面对学校限制人身自由的问题，常见的处理方式包括：1. 协商沟通：首先尝试与学校管理层沟通，表达自身诉求，寻求合理解决方案。2. 投诉举报：若协商无果，可向教育部门或相关行政机关投诉举报，要求介入调查并处理。3. 法律诉讼：在必要时，可提起民事诉讼，要求学校承担侵权责任，赔偿损失。选择方式：根据问题的严重程度和具体情况，选择合适的处理方式。若问题较轻，可先尝试协商沟通；若问题严重，则可直接投诉举报或法律诉讼。